令和７年（2025年）３月24日，陸海空自衛隊の実動部隊を一元的に指揮する常設組織として，統合作戦司令部が防衛省のある市ヶ谷地区に200名規模で新編された。初代司令官は南雲憲一郎空将で，統幕長および陸海空幕長と同じく，米軍の大将（四つ星）に相当するポストとなった。これは米軍の中将（三つ星）に相当する，陸上総隊司令官，自衛艦隊司令官，航空総隊司令官などよりも一格上であることを示したもの。

　統合作戦司令部の設置は，令和４年12月に策定された安保３文書で明記されていたもので，有事や大規模災害派遣等の際，防衛大臣の補佐等に忙殺される統幕長に代わり，統合作戦司令官が一元的に陸海空部隊の指揮を行なうことで，意思決定の迅速化や各種事態への対処能力の強化等が期待される。